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发菌以“井”字形堆叠，高约1m，底部用石块或废木垫空，要求堆内温度控制在20兀以上、28兀以下，晴天中午气温高时应撑膜通风降温。每周将段木上下、内外翻动1次，促进发菌均匀。约经30d，接种穴和树皮下长满菌丝，发菌结束。埋土养菌及子实体发生选排水良好、有水源或树荫下作菌床，畦床宽1.2m，深20cm。将段木横向排放在菌床内，段木间距5cm，以无杂质的细壤土填没段木间隙，而后上面覆2cm的土层。搭荫棚离菌床高60cm，棚上盖稀草帘，外覆薄膜，防止直射光和大雨冲刷。这段时间，减少水分供给，养菌约30d。当段木两端断面上具有黄白色菌丝即进入子实体发生阶段，增加空间的湿度，晴天喷水1~2次，保持土壤湿润。7月初子实体陆续发生。第2年5~7月盛产，第3年仍有子实体产生。
灵芝包括多孔菌科灵芝属真菌赤芝Ganodermalucidum（Leyss.exFr.）Karst.或紫芝G.sinenseZhao,XuetZhang,具有补气安神、止咳平喘等功效，主治虚劳、心悸、失眠、头晕、神疲乏力、久咳气喘、冠心病、矽肺、肿瘤⑵。我国是早认识和利用灵芝的，关于灵芝扶正固本、滋补强壮的作用历代的医药学专著均有记载，两千多年前的周朝，《列子?汤问》一书中就记载了“朽壤之上，有菌者芝……煮汤沸其味清芳，饮之明目、心静、肾坚、脑清，其宝物也J《神农本草经》记载了六种灵芝:赤芝、青芝、黄芝、白芝、黒芝和紫芝，《本草纲目》更是详细的记录了灵芝的种类、药性。灵芝功效不断得到验证，对灵芝的药理作用研究也已走向世界，如美国、日本、英国等先后开展了对灵芝的药理与临床的深入研究，《美国草药药典》也正式收载了灵芝，而该药典迄今只收录十来种中药材或天然药物，足以看出全球对灵芝类药材的重视。
出芝管理前期管理（埋棒后20天）菌袋埋土后，主要为水分、通气、温度光照三要素的调节，要保持适宜的温度、湿度、光照和控制通风量，温度要保持在22—26T，空气相对湿度要保持在85%—90%，初期以保温为主，白天拉开一层遮阳网，接受光照，避免日光直射，增加土壤温度，中午气温过高时，应开窗通风，喷水降温。在汉中约15d原基便可零星露出土表。中期管理（埋棒后20—40d）气温上升，温差较大，白天注意降温，控制温度在22—28空气相对湿度要保持在90%—95%;晚间应放下薄膜减少温差。光照采用双层遮阳网控制，制造出闪烁型林下散射光。此阶段，菌原基生长较快，每2—3d要进行通风换气，灵芝对二氧化碳非常敏感，否则，会造成灵芝菌柄长、不开伞或畸形。在此期间要定苗修头，原基生长20d后海袋选留1株强势菌株，并对其上生长点进行修头，即修成马蹄形，利于商品外形一致，提高灵芝菌盖的商品率，一般次修完后10d，应再进行一次留株修头。
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